Yii 假定了一系列默认的目录用于不同的场合。如果需要，每个目录都可以自定义。

• WebRoot/protected:

  这是 应用基础目录， 是放置所有安全敏感的PHP脚本和数据文件的地方。Yii 有一个默认的 application 别名指向此目录。 此目录及目录中的文件应该保护起来防止Web用户访问。它可以通过 CWebApplication::basePath 自定义。

• WebRoot/protected/runtime:

  此目录放置应用在运行时产生的私有临时文件。 此目录必须对 Web 服务器进程可写。它可以通过 CApplication::runtimePath自定义。

• WebRoot/protected/extensions:

  此目录放置所有第三方扩展。 它可以通过 CApplication::extensionPath自定义。

• WebRoot/protected/modules:

  此目录放置所有的应用 模块，每个模块使用一个子目录。

• WebRoot/protected/controllers:

  此目录放置所有控制器类文件。 它可以通过CWebApplication::controllerPath 自定义。

• WebRoot/protected/views:

  此目录放置所有视图文件， 包含控制器视图，布局视图和系统视图。 它可以通过 CWebApplication::viewPath 自定义。

• WebRoot/protected/views/ControllerID:

  此目录放置单个控制器类中使用的视图文件。 此处的ControllerID 是指控制器的 ID 。它可以通过 CController::viewPath 自定义。

• WebRoot/protected/views/layouts:

  此目录放置所有布局视图文件。它可以通过CWebApplication::layoutPath 自定义。

• WebRoot/protected/views/system:

  此目录放置所有系统视图文件。 系统视图文件是用于显示异常和错误的模板。它可以通过 CWebApplication::systemViewPath 自定义。

• WebRoot/assets:

  此目录放置公共资源文件。 资源文件是可以被发布的，可由Web用户访问的私有文件。此目录必须对 Web 服务器进程可写。 它可以通过 CAssetManager::basePath 自定义

• WebRoot/themes:

  此目录放置应用使用的不同的主题。每个子目录即一个主题，主题的名字即目录的名字。 它可以通过 CThemeManager::basePath 自定义。